В TES CS:
Настройки журнала (в смысле сообщения, которые появляются в журнале ПиСяя) - это скрипты или нет? Если нет, то что.
Как настроить?

Это в Dialog смотри. :) Топики и все остальное добавляется скриптом. Механизм довольно прозрачный, что-то вроде player->addtopic "222". :)

Кстати, многие события запускаются (скажем, возможность сдать квест) после того, как появляется определенная запись в журнале.